Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PTPRDP23468 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
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PTPRDP23468 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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PTPRDP23468 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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PTPRDP23468 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
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