Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NPHP4O75161 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPHP4O75161 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms