Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXA3O43365 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXA3O43365 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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