Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
LRRTM2O43300 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRRTM2O43300 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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