Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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RRN3Q9NYV6 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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RRN3Q9NYV6 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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RRN3Q9NYV6 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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RRN3Q9NYV6 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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RRN3Q9NYV6 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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RRN3Q9NYV6 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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RRN3Q9NYV6 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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RRN3Q9NYV6 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RRN3Q9NYV6 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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