Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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ZBED3Q96IU2 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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ZBED3Q96IU2 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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ZBED3Q96IU2 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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ZBED3Q96IU2 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
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ZBED3Q96IU2 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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ZBED3Q96IU2 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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