Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF18Q96CE8 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF18Q96CE8 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.2 ms