Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SWI5Q1ZZU3 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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