Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RTN1Q16799 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
RTN1Q16799 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RTN1Q16799 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms