Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms