Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHHQ15465 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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