Protein–RNA interactions for Protein: Q15053

KIAA0040, Uncharacterized protein KIAA0040, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0040Q15053 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KIAA0040Q15053 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KIAA0040Q15053 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms