Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERPUD1Q15011 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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