Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SMC1AQ14683 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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