Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.66□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
SPTAN1Q13813 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
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