Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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SHROOM2Q13796 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
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SHROOM2Q13796 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
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SHROOM2Q13796 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
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SHROOM2Q13796 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
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SHROOM2Q13796 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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SHROOM2Q13796 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
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SHROOM2Q13796 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
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SHROOM2Q13796 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
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