Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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