Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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CUL3Q13618 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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CUL3Q13618 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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CUL3Q13618 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CUL3Q13618 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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