Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1AQ13111 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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