Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
IFT88Q13099 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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