Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
GRIN2AQ12879 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GRIN2AQ12879 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.49□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.5□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GRIN2AQ12879 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
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