Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNTN1Q12860 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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