Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXO1Q12778 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms