Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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HOXC5Q00444 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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HOXC5Q00444 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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HOXC5Q00444 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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HOXC5Q00444 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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HOXC5Q00444 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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HOXC5Q00444 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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