Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VPREB1P12018 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VPREB1P12018 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms