Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRCP08575 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRCP08575 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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