Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HCN3Q9P1Z3 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HCN3Q9P1Z3 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
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