Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
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RRN3Q9NYV6 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RRN3Q9NYV6 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RRN3Q9NYV6 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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