Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PHACTR1Q9C0D0 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PHACTR1Q9C0D0 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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