Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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