Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CLPPQ16740 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CLPPQ16740 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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