Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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NFIL3Q16649 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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NFIL3Q16649 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NFIL3Q16649 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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