Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPE65Q16518 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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