Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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SSX1Q16384 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SSX1Q16384 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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SSX1Q16384 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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SSX1Q16384 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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SSX1Q16384 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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SSX1Q16384 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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SSX1Q16384 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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SSX1Q16384 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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SSX1Q16384 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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SSX1Q16384 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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