Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
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SS18Q15532 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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SS18Q15532 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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SS18Q15532 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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SS18Q15532 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SS18Q15532 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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SS18Q15532 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SS18Q15532 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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SS18Q15532 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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SS18Q15532 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SS18Q15532 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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SS18Q15532 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SS18Q15532 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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