Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC3Q15034 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC3Q15034 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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