Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBE4AQ14139 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
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UBE4AQ14139 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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