Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
PICALMQ13492 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PICALMQ13492 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.4 ms