Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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TCOF1Q13428 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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TCOF1Q13428 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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TCOF1Q13428 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.91□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
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