Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
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ERCC8Q13216 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
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ERCC8Q13216 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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ERCC8Q13216 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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ERCC8Q13216 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERCC8Q13216 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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