Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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