Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1AQ13111 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1AQ13111 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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