Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRDM2Q13029 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRDM2Q13029 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
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