Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CSTF3Q12996 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CSTF3Q12996 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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