Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNTN1Q12860 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNTN1Q12860 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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