Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGGTBP53611 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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