Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CITED1Q99966 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CITED1Q99966 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CITED1Q99966 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CITED1Q99966 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CITED1Q99966 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CITED1Q99966 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CITED1Q99966 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CITED1Q99966 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CITED1Q99966 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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CITED1Q99966 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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CITED1Q99966 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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CITED1Q99966 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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CITED1Q99966 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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CITED1Q99966 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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CITED1Q99966 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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CITED1Q99966 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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CITED1Q99966 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CITED1Q99966 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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CITED1Q99966 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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