Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CCDC47Q96A33 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CCDC47Q96A33 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CCDC47Q96A33 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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