Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TOP1MTQ969P6 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TOP1MTQ969P6 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.8 ms