Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDR2Q16832 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDR2Q16832 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
DDR2Q16832 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms